SPL output

Search for potential splice sites

 Name: Seq_name:all
 First three lines of sequence:
 TTANGATTCGTTTCCATGGAGCTGCCCATGACCATTTACACCATATACATACTGTCTCTGAGCAGAGATACGACA
 CTCAGGCTGGTGATAAGGGAACACAGCTGTCAGGGGGCCAGAAGCAGCGTGTCGCCATAGCCCGAGCCATCATCC
 GCAACCCCAAACTGTTGCTCCTGGACGAGGCCACGTCTGCGCTCGACACTGAGAGTGAGAAGGTGAGACTTTATT


 spl  Thu Jun  3 19:59:14 CDT 1999
   orgzm =h
 >Seq_name:all                                                                   
  Length of sequence -  39951
 Number of Donor    sites:   73 Threshold: 0.76
     1    205  0.76
     2    213  0.87
     3   1139  0.79
     4   2153  0.83
     5   2381  0.81
     6   2716  0.77
     7   2782  0.77
     8   2811  0.80
     9   2892  0.76
    10   3782  0.77
    11   3925  0.79
    12   4258  0.88
    13   4748  0.80
    14   5154  0.82
    15   5931  0.83
    16   6459  0.81
    17   6714  0.78
    18   7539  0.83
    19   8084  0.80
    20   9296  0.88
    21   9653  0.79
    22   9930  0.82
    23  10055  0.78
    24  10370  0.76
    25  10913  0.77
    26  12343  0.79
    27  12584  0.77
    28  12592  0.87
    29  13035  0.78
    30  13452  0.78
    31  13558  0.80
    32  13785  0.78
    33  14710  0.80
    34  15261  0.78
    35  15362  0.82
    36  15399  0.77
    37  15404  0.86
    38  16085  0.80
    39  16285  0.82
    40  16424  0.77
    41  16663  0.78
    42  17601  0.81
    43  17717  0.79
    44  17976  0.81
    45  18231  0.84
    46  18555  0.78
    47  18776  0.81
    48  18814  0.79
    49  19566  0.78
    50  19775  0.87
    51  19931  0.85
    52  20159  0.79
    53  20436  0.76
    54  20859  0.77
    55  21899  0.80
    56  23030  0.76
    57  23271  0.77
    58  23279  0.87
    59  24911  0.86
    60  26508  0.78
    61  26550  0.78
    62  28507  0.76
    63  28663  0.81
    64  32318  0.80
    65  32625  0.79
    66  32761  0.79
    67  33311  0.79
    68  33655  0.81
    69  36222  0.83
    70  36604  0.82
    71  36912  0.84
    72  37795  0.79
    73  38014  0.78
 Number of Acceptor sites:  111 Threshold: 0.65
     1    284  0.69
     2    639  0.76
     3   2079  0.74
     4   2089  0.71
     5   2628  0.70
     6   2857  0.76
     7   2860  0.65
     8   3355  0.66
     9   3473  0.76
    10   4132  0.70
    11   4376  0.79
    12   5301  0.66
    13   5607  0.72
    14   5740  0.65
    15   5804  0.73
    16   6254  0.65
    17   7090  0.87
    18   7485  0.66
    19   7719  0.68
    20   7752  0.69
    21   7828  0.69
    22   8452  0.69
    23   9568  0.70
    24   9621  0.70
    25   9725  0.75
    26   9732  0.69
    27  10030  0.81
    28  10280  0.67
    29  10427  0.66
    30  10798  0.69
    31  11176  0.65
    32  11242  0.89
    33  11486  0.79
    34  11489  0.67
    35  12007  0.68
    36  12135  0.77
    37  12207  0.65
    38  12400  0.65
    39  12663  0.69
    40  13612  0.65
    41  13729  0.76
    42  13930  0.66
    43  14374  0.65
    44  14430  0.86
    45  14443  0.75
    46  14867  0.66
    47  14901  0.68
    48  14938  0.72
    49  15912  0.81
    50  16195  0.65
    51  16474  0.73
    52  16563  0.65
    53  16573  0.65
    54  16800  0.65
    55  16978  0.65
    56  17295  0.75
    57  17441  0.70
    58  17474  0.77
    59  17655  0.66
    60  17771  0.80
    61  18265  0.70
    62  18613  0.68
    63  18866  0.79
    64  19418  0.68
    65  19452  0.68
    66  19556  0.65
    67  19669  0.73
    68  19879  0.66
    69  20074  0.69
    70  20127  0.72
    71  20231  0.75
    72  20238  0.69
    73  20318  0.67
    74  20521  0.84
    75  20717  0.67
    76  20906  0.67
    77  21565  0.87
    78  22131  0.65
    79  22328  0.67
    80  22821  0.80
    81  22893  0.65
    82  23350  0.72
    83  23650  0.71
    84  24366  0.69
    85  24577  0.67
    86  25120  0.66
    87  25221  0.70
    88  25282  0.66
    89  25511  0.69
    90  25587  0.66
    91  26591  0.71
    92  26677  0.67
    93  26767  0.66
    94  27226  0.73
    95  27474  0.66
    96  31182  0.66
    97  31195  0.68
    98  32371  0.75
    99  32373  0.77
   100  33348  0.67
   101  33631  0.68
   102  34052  0.70
   103  34381  0.67
   104  34749  0.71
   105  35872  0.65
   106  36943  0.66
   107  37154  0.68
   108  37357  0.68
   109  38432  0.73
   110  39020  0.85
   111  39480  0.66