课程概况

• 上课时间：周日下午2:00-2:50, 3:00-3:50, 4:00-4:50
• 上课地点：教学楼第1和第2语音教室
• 学时学分：周学时3，总学时48（16周），2.5学分
• 评分方式：期末总结报告WORD文档(15分)+期末小组交流报告PPT文档(15分)+考勤(10分)+课堂表现(20分)+ 课堂练习(20分)+小组讨论(20分)

课程简介

• 选课对象：2025级研究生
• 选课要求：具有较好的生物化学和分子生物学基础 (生物学自测题) 和英语阅读理解能力 (英文生物学自测题)
• 教学方法：上机操作为主，除课堂教学外，参与课外小组讨论、完成课外练习
• 教学模式：线上教学，包括腾讯会议、电子邮件、微信
• 课程内容：网络文档、文献检索、序列分析、数据库搜索、系统发生树构建、蛋白质结构分析和预测 (详见教学大纲)
• 教学目的：本课程是一门上机操作实验课，结合具体实例，介绍常用生物信息技术和分析思路， 为课题研究提供参考
• 课程宗旨：Half day on the Web, saves you half month in the lab！网上半日游，解你半月愁！
• 课程特色：三个“题”：结合课题、带着问题、多做例题，对应英文三个P：Project, Problem, Practice

参考文献

1. 罗静初，序列数据库搜索系统BLAST简介， 《生物信息学》，2025年，第23卷，第3期，第165-174页. [PDF]
2. 罗静初，双序列比对基础和应用实例， 《生物信息学》，2023 年，第 21 卷，第 1 期，第1-19 页. [PDF]
3. 罗静初，EMBOSS 软件包序列分析程序应用实例， 《生物信息学》，2021 年，第 19 卷，第 1 期，第 1-25 页. [PDF]
4. 罗静初，EMBOSS和EMBnet， 《生物信息学》，2021 年，第 21 卷，第 4 期，第 223-231页. [PDF]
5. 罗静初，UniProt 蛋白质数据库简介， 《生物信息学》，2019 年，第 17 卷，第 3 期，第131-144 页. [PDF]
6. 罗静初，实用生物信息技术课程教学实例。 《生物技术通报》，2015 年，第 31 卷，第11 期 ， 第 102-111 页 . [PDF]
7. Luo J. Teaching the ABCs of bioinformatics: a brief introduction to the Applied Bioinformatics Course. Brief Bioinform. 2014 Nov;15(6):1004-1013. [PDF]